O PPGANTS/UFRR conta com os seguintes Grupos e Laboratórios de Pesquisa, coordenados e/ou vice coordenados por docentes permanentes do Programa.
ANDANÇAS – Laboratório de Etnografia, coordenado pelo Prof. José Flores.
Antropologia e os direitos sociais dos indígenas e dos migrantes refugiados, coordenado pelo Prof. Carlos Cirino.
Ethnogra – Etnografias Contemporâneas: Memória, Identidade e Urbanidades, coordenado pela Profa. Madiana Rodrigues.
LABORR – Laboratório de Estudos sobre o Rural em Roraima, coordenado pela Profa. Manuela Cordeiro.
Nova Cartografia Social na Amazônia – Núcleo Roraima, Laboratório coordenado localmente pelo prof. Carlos Cirino.
NUHSA – Núcleo Histórico Socioambiental, Núcleo associado ao PPGANTS/UFRR.
Grupo de Pesquisa Saúde, Educação e Ambiente, coordenado pela Profa. Fabíola Christian (Insikiran/PROCISA) e vice coordenado pelo prof. Fernando Ciello.